Межэтажное перекрытие есть, а межэтажную бетонную лестницу не учли. Фундамент есть, а утепление фундамента, или дренаж, или ливневку или колодцы, да я могу бесконечно продолжать перечисление — не учли. Что должно быть в кровле кроме кровли? Снегозадержание, водостоки, софиты, лобовые доска и планка. Они есть в твоей смете или нет?

Почему так происходит? Может забыли, может не хотели стоимость сметы завышать и потом решили «обрадовать» заказчика. А может что-то сейчас и не надо делать и в принципе это подразумевалось сделать следующим этапом?
Но в любом случае, если этого в смете нет, платить придётся тебе. И да, если какого-то материала не хватит, его то же постараются повесить на тебя.
И если ты читал уже пункты договора, с юридической стороны я старался тебя подстраховать, но всё же

Рекомендация:

Разберись в том, что ты хочешь, чтобы тебе построили. Проси на пальцах рассказать, что за эти деньги ты получишь, а главное, за что потом ещё придётся платить

⚠️ Ну или сохрани ты себе нервы, наймите моих спецов на работу. Зачем ты сам себя хочешь мучать? 😜